行政职能科室：办公室、组织人事科、规划财务科；

    业务科室：科技教育科、中药应用开发研究室、大健康产品研究室、中药资源研究室、创新药物研究室、药理研究室、中医临床研究室、中医药发展政策研究室、中医药信息文献研究室、科技合作与成果转化室。