江西省中医药研究院拥有国家中医药管理局授予的中医药文献检索中心南昌分中心、国家中医药管理局三级实验室2个（中药药理、中药分析）、江西省中药原料质量监测技术服务中心，国家农业农村部批准的国家中药材产业技术体系南昌综合试验站，省级工程研究中心2个(省发改委批准的江西省中药资源保护与开发利用工程研究中心、省科技厅批准的江西省中药质量标准工程技术研究中心)，省中医药管理局重点研究室2个(江西道地特色中药材标准化重点研究室、中药材种质选育繁育重点研究室)，江西省中药资源协同创新中心，江西省中医药文化宣传教育基地，江西省中医药文化旅游协同创新中心，省国医名师传承工作室1个，全国名老中医传承工作室3个，江西省中医药学会、江西省中西医结合学会、江西省中医药志愿者联合会、江西省中医药标准化技术委员会的挂靠单位，江西中医药大学中医学、中药学研究生联合培养基地等科研平台。

   我院拥有的大型科研仪器设备主要包括：高效液相色谱仪(Waters Alliance E2695)、定量PCR仪(Applied QuantStudio 5)、超高效液相系统（Waters ACQUITY UPLC H-Class）、质谱仪(Waters ACQUity QDa)、高效液相色谱仪(Waters Arc HPLC)、液相色谱仪(Agilent 1260 Infinity III)、Zeta粒度和电位分析仪(MalvernPanalytical Zetasizer Pro)、原子吸收光谱仪(PerkinElmer PinAAcle900T)等。